Directory Monitor - мощнейшая программа по отслеживанию изменения в заданных папках, ведя журнал и выводя на экран уведомления о событиях. Так же он способен запускать программы при определенных событиях. Вам надо просто назначить папки за которыми программа будет следить и при необходимости установить фильтры событий.